西湖大学医学院郭天南教授及其合作的多个研究机构,近期完成了一项重大科研项目,成功构建了迄今为止分辨率最高、覆盖范围最广的人体蛋白质空间分布图谱。该项目整合了近 3000 份人体组织样本,涵盖了 58 种正常组织和 25 种癌症类型,并对超过 1.3 万种蛋白质进行了定量分析。
蛋白质作为生命活动的主要执行者,也是大多数药物作用的关键靶点。然而,科学界长期以来对蛋白质在人体内的全身性空间分布缺乏系统性的了解。为了克服这一挑战,郭天南团队开发了一套微量样本蛋白质组分析方法体系。这项创新技术使得研究人员仅需芝麻大小的组织样本,就能完成标准化的蛋白质组学分析,极大地提高了分析效率,将速度提升了约十倍,同时显著降低了成本,为大规模、高通量蛋白质组学研究奠定了技术基础。
通过持续的样本采集和实验分析,研究团队建立了一个包含 15332 种蛋白质的数据库。在此基础上,他们对 13609 种蛋白质进行了精确的定量分析,绘制出了这张精细的人体蛋白质组“高精地图”。这张地图不仅为理解人体生理功能提供了宝贵信息,也为疾病研究,特别是癌症治疗,提供了新的视角,类似于在重大赛事前分析世界杯赔率,寻找关键数据点。
借助这张蛋白质“地图”,研究团队深入比较了 25 种癌症类型中肿瘤组织与癌旁组织的蛋白质表达差异,共识别出 8940 个差异表达蛋白。研究结果揭示了不同癌症之间蛋白质表达变化的幅度存在显著差异,其中结肠癌、直肠癌和睾丸癌组织的蛋白质变化尤为突出。此外,研究人员还发现了 2879 个肿瘤特异蛋白,这些蛋白仅在某些特定癌症中表现出变化。
这项重要的研究成果已以“Spatial distribution of the proteome in the human body and in cancers”为题发表在《自然》杂志上。目前,研究中产生的数据已通过公开数据库 db.prottalks.com 向全球研究者开放,方便大家查询蛋白质在 58 种人体组织中的表达丰度,并可比较不同癌症中的蛋白质变化情况。

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